Difference between revisions of "Category:Strain:Bacillus subtilis 168"

From OMPwiki
(touch table)
(make redirect)
 
(One intermediate revision by one other user not shown)
Line 1: Line 1:
−
__TOC__
+
#redirect [[OMP_ST:796_!_Strain:Bacillus subtilis 168]]
−
 
 
−
==Strain Summary==
 
−
<protect><!--box uid=d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e.6257.K5589a3c665557-->
 
−
<!--
 
−
******************************************************************************************
 
−
*
 
−
*  ** PLEASE DON'T EDIT THIS TABLE DIRECTLY.  Use the edit table link under the table. **
 
−
*
 
−
****************************************************************************************** -->
 
−
{|  id="K5589a3c665557"  class=" tableEdit Strain_info_table" 
 
−
 
 
−
|-
 
−
!align=left align='left' bgcolor='#CCCCFF' |Strain Name
 
−
||
 
−
168
 
−
|-
 
−
!align=left align='left' bgcolor='#CCCCFF' |Synonyms
 
−
||
 
−
subtilis 168
 
−
|-
 
−
!align=left align='left' bgcolor='#CCCCFF' |Taxon Information
 
−
||
 
−
*Pangenome: Bacillus subtilis
 
−
*Taxon: 168
 
−
*NCBI Taxon ID: 224308
 
−
|-
 
−
!align=left align='left' bgcolor='#CCCCFF' |Genotype
 
−
||
 
−
other:trpC2
 
−
|-
 
−
!align=left align='left' bgcolor='#CCCCFF' |Strain Reference
 
−
||
 
−
PMID:4986704
 
−
|-
 
−
!align=left align='left' bgcolor='#CCCCFF' |Strain availability
 
−
||
 
−
[http://www.bgsc.org/viewdetail.php?bgscid=1A1&Search=168 Bacillus Genetic Stock Center]
 
−
|-
 
−
!align=left align='left' bgcolor='#CCCCFF' |Ancestry
 
−
||
 
−
parent:Bacillus subtilis Marburg
 
−
|-
 
−
!align=left align='left' bgcolor='#CCCCFF' |Annotated phenotypes
 
−
||
 
−
 
 
−
 
 
−
|- class="tableEdit_footer"
 
−
|<div class="tableEdit_editLink plainlinks">[{{SERVER}}{{SCRIPTPATH}}?title=Special:TableEdit&id=d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e.6257.K5589a3c665557&page=6257&pagename={{FULLPAGENAMEE}}&type=1&template=Strain_info_table edit table]</div> ||
 
−
|}
 
−
<noinclude>
 
−
<!-- OMP category tags -->[[Category:Strains that need OMP_ST accessions]]
 
−
</noinclude>
 
−
<!--box uid=d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e.6257.K5589a3c665557--></protect>
 
−
 
 
−
==Notes==
 
−
 
 
−
 
 
−
==Phenotype Annotation==
 
−
<protect><!--box uid=d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e.6257.T5589a3c668865-->
 
−
<!--
 
−
******************************************************************************************
 
−
*
 
−
*  ** PLEASE DON'T EDIT THIS TABLE DIRECTLY.  Use the edit table link under the table. **
 
−
*
 
−
****************************************************************************************** -->
 
−
{| border="2" cellpadding="4" cellspacing="0" style="margin: 1em 1em 1em 0; border: 1px #aaa solid; border-collapse: collapse;"  id="T5589a3c668865"  class=" tableEdit OMP_annotation_table dataTable" 
 
−
|- align='left' bgcolor='#CCCCFF'
 
−
!|Annotation ID!!not!!OMP ID!!OMP term name!!Relative phenotype information!!Experimental condition!!ECO ID!!ECO term name!!Reference!!Annotation Extension!!Notes
 
−
|-
 
−
|
 
−
OMP_AN:107
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
OMP:0000017
 
−
|
 
−
presence of endospore formation
 
−
|
 
−
Relative to:
 
−
 
 
−
<hr>Genotype differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
<hr>Condition differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
|
 
−
*temperature:37C
 
−
*medium:liquid sporulation medium<ref name='PMID:4972255'/>
 
−
|
 
−
ECO:0001098
 
−
|
 
−
microscopy evidence
 
−
|
 
−
PMID:4972256
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
requires indole or tryptophan for growth
 
−
|-
 
−
|
 
−
OMP_AN:147
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
OMP:0000017
 
−
|
 
−
presence of endospore formation
 
−
|
 
−
Relative to:
 
−
 
 
−
<hr>Genotype differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
<hr>Condition differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
|
 
−
*temperature:37C
 
−
*medium:MnCl<sub>2</sub> (0.01 mM)
 
−
*medium:[[Minimal medium of Spizizen|glucose minimal medium]]
 
−
|
 
−
ECO:0000182
 
−
|
 
−
in vitro culture assay evidence
 
−
|
 
−
PMID:4633157
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
colony morphology on sporulation medium
 
−
|-
 
−
|
 
−
OMP_AN:241
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
OMP:0000017
 
−
|
 
−
presence of endospore formation
 
−
|
 
−
Relative to:
 
−
 
 
−
<hr>Genotype differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
<hr>Condition differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
|
 
−
*other:shaking
 
−
*temperature:37C
 
−
*medium:hydrolyzed casein and inorganic ions
 
−
|
 
−
ECO:0000182
 
−
|
 
−
in vitro culture assay evidence
 
−
|
 
−
PMID:4625072
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
 
−
|-
 
−
|
 
−
OMP_AN:243
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
OMP:0000017
 
−
|
 
−
presence of endospore formation
 
−
|
 
−
Relative to:
 
−
 
 
−
<hr>Genotype differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
<hr>Condition differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
|
 
−
*temperature:37C
 
−
*medium:minimal medium
 
−
|
 
−
ECO:0000182
 
−
|
 
−
in vitro culture assay evidence
 
−
|
 
−
PMID:4197271
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
pigmented colony morphology on minimal media
 
−
 
 
−
still looking for specific medium components
 
−
|-
 
−
|
 
−
OMP_AN:247
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
OMP:0000017
 
−
|
 
−
presence of endospore formation
 
−
|
 
−
Relative to:
 
−
 
 
−
<hr>Genotype differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
<hr>Condition differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
|
 
−
*temperature:37C
 
−
*medium:hydrolyzed casein
 
−
|
 
−
ECO:0001098
 
−
|
 
−
microscopy evidence
 
−
|
 
−
other:<ref>Jenkinson HF. Germination and resistance defects in spores of a Bacillus subtilis mutant lacking a coat polypeptide. J Gen Microbiol. 1981;127: 81-91</ref>
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
 
−
|-
 
−
|
 
−
OMP_AN:373
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
OMP:0000017
 
−
|
 
−
presence of endospore formation
 
−
|
 
−
Relative to:
 
−
 
 
−
<hr>Genotype differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
<hr>Condition differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
|
 
−
*other:100 rpm gyratory shaking
 
−
*pH:7
 
−
*temperature:37C
 
−
*medium:Difco nutrient broth<ref name='PMID:4995746'/>
 
−
|
 
−
ECO:0001098
 
−
|
 
−
microscopy evidence
 
−
|
 
−
PMID:1900505
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
FeCL2 omitted from medium
 
−
|-
 
−
|
 
−
OMP_AN:387
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
OMP:0000017
 
−
|
 
−
presence of endospore formation
 
−
|
 
−
Relative to:
 
−
 
 
−
<hr>Genotype differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
<hr>Condition differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
|
 
−
*temperature:37C
 
−
*medium:nutrient broth sporulation medium
 
−
|
 
−
ECO:0000182
 
−
|
 
−
in vitro culture assay evidence
 
−
|
 
−
PMID:108357
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
 
−
|-
 
−
|
 
−
OMP_AN:389
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
OMP:0000017
 
−
|
 
−
presence of endospore formation
 
−
|
 
−
Relative to:
 
−
 
 
−
<hr>Genotype differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
<hr>Condition differences:<br>
 
−
Nothing to compare<br/>
 
−
|
 
−
*temperature:37C
 
−
*medium:[[Sporulation medium of Sterlini and Mandelstam|sporulation medium]]
 
−
*medium:glutamate
 
−
|
 
−
ECO:0000182
 
−
|
 
−
in vitro culture assay evidence
 
−
|
 
−
PMID:3934335
 
−
|
 
−
 
 
−
|
 
−
 
−
 
 
−
|- class="tableEdit_footer"
 
−
|<div class="tableEdit_editLink plainlinks">[{{SERVER}}{{SCRIPTPATH}}?title=Special:TableEdit&id=d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e.6257.T5589a3c668865&page=6257&pagename={{FULLPAGENAMEE}}&type=0&template=OMP_annotation_table edit table]</div> || || || || || || || || || ||
 
−
|}
 
−
<noinclude>
 
−
<!-- OMP category tags -->
 
−
</noinclude>
 
−
<!--box uid=d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e.6257.T5589a3c668865--></protect>
 
−
 
 
−
 
 
−
==Additional Information==
 
−
 
 
−
 
 
−
==Links==
 
−
 
 
−
 
 
−
==References==
 
−
{{RefHelp}}<references/>
 

Latest revision as of 17:18, 8 January 2016

This category currently contains no pages or media.